Boruto: Naruto Next Generations menceritakan tentang dunia ninja yang damai setelah peperangan yang terjadi di Naruto: Shippuuden. Cerita berfokus terhadap Boruto Uzumaki yang merupakan putra dari sang ninja legendaris penyelamat dunia, Naruto Uzumaki yang kini menjabat sebagai Hokage ke-7. Boruto memiliki sifat yang keras kepala dan susah diatur, ia ingin terbebas dari kehidupan yang mengekangnya dan ingin melangkah bebas sesuai keinginannya sendiri. Kehidupan para ninja generasi baru di dunia yang sedang berevolusi menjadi modern membuat tujuan utama para shinobi berubah, tak lagi berfokus pada kekuatan dan peperangan, mereka harus ikut dalam perkembangan jaman dan teknologi. Bagaimanakah kisah Boruto dan teman-temannya beserta seluruh shinobi di generasi baru kali ini?